中国佛学院灵岩山分院位于饮誉中外净土道场苏州灵岩山寺，是净土十三祖印光大师圆寂的地方。妙真和尚创办灵岩山寺西有研究社，1948年扩充成为灵岩山寺净宗佛学院，学僧48名，1959年后停办。1980年开办中国佛学院灵岩山分院。
灵岩山又称石城山、石鼓山、砚石山、象山。在春秋时代，曾是吴王夫差的馆娃宫，这大概是公元前四百多年前的事情。据史书记载，东晋元帝（326一334在位）的司空陆玩舍宅为寺，梁武帝天监年间（502519）增拓为秀峰寺，天监十五年（516）智积菩萨应化此山，遂为智积菩萨显化道场。天监二年（503）建成供奉佛舍利的灵岩塔，即今多宝塔。南宋绍兴年间（11311163），太傅、韩蕲王（韩世忠）于寺荐先福，名显亲崇报寺。明洪武改为十方丛林。明清时二度毁于火，重建规模难复昔日辉煌。清宣统三年（1911），普陀山三圣堂真达上人被请住持本山，开始了兴复的工作。民国十五年（1926），开为十方净土道场。院事由妙真上人实际负责。二十六年（1937）冬，印光大师移锡灵岩。二十九年（1940）终寂于此，奠定了净土道场的特殊地位。
灵岩山寺，1948年在过去西有研究社的基础上开办净宗佛学院，当时担任教学工作的法师大多毕业于宁波观宗讲寺。如：碧林、莲因、化东、梵光、种莲等法师，讲授《弥陀要解》、《四教仪集注》等天台、净土课程。那时的方丈和尚妙真上人也是观宗寺的学生。因此，灵岩山一直传持教遵天台，行归净土的传统。