祖师之堂，设于佛殿西边。
《白云端和尚禅录·祖堂纲纪序》云：“吾道盛于此土，初祖菩提达磨之纲焉；创立禅林之制，百丈大智之纪焉。此实天下之共知，而柰何天下祖堂中，各以开山传次者为其祖，殊不思乃宗乃祖所传所持之最者乎？呜呼！教来五百年后，达磨始来，向之诸家之贤者，岂不知性即乎圣？何为竟自以性以圣之泥乎？乃须少林之后，犹弹指顷，不假文字，语默有无，释然亡其所待，而自得还其本。又古之巖居穴处者，但以法为胜为味，殊不虑今日其间者骄，独大智禅师虑之，而廓以禅林之度，由是资之，而少林之风至今蔼然于天下。吾欲天下祖堂中，以达磨、大智正其位，以开山传次者陪之，贵来者尊其始而归其大，岂不然乎？熙宁三年岁次庚戌十月初一日立。”
《林间录》云：“白云端禅师曰：‘天下丛林之兴，大智禅师力也。祖堂当设达磨初祖之像于其中，大智禅师像西向，开山尊宿像东向，得其宜也。不当止设开山尊宿而略其祖宗耳。’”
《敕修清规·欣笑隐尊祖章序》云：“海会端公谓：‘宜祀达磨于中，百丈陪于右，而各寺之开山祖配焉。见于〈祖堂纲纪序〉云。’”
忠曰：“〈纲纪序〉无左右说，然《清规·言百丈陪于右，而今禅林安像，例而达磨南面，百丈在东，则陪于祖左也；临济在西，则陪于祖右也。依此旧说纷纭，或曰：‘《林间录》已言大智像西向，是亦可约达磨南面，则陪于祖左明矣。故今右字写讹，当改左字，即百丈配昭位，左东。某寺开山配穆位，右西。 正为当理也。’或曰：‘右字不可改也，但某寺崇开山故，开山安祖左，东也。百丈安祖右西也。矣。’”
或曰：“右者谓向真人之右也，则北面向真故，右则东也，合现今禅林
安像法。”
忠曰：“向真人之右之说，甚失义也。何故？谓凡规制书无此例。圣节榜张于三门之右者，言门西也。圣节上堂，侍者往法座左侧立者，言座东也。儒礼亦然，《文公家礼》云：‘凡屋制不问何向背，但以前为南，后为北，左为东，右为西，后皆仿此。止此 ’何遽作向真人之左右说耶？其尊开山抑百丈固不足取焉，改左字者，义同《林间》，故不在痛削。然以余观之，笑隐云陪于右，大有深意。盖达磨为太祖、二祖昭、三祖穆，如此次第配之，则百丈穆位而在达磨之右。西也。笑隐之意，岂在兹乎？犹如周后稷为祖，文王穆、武王昭矣。〈纲纪序〉本不言左右，觉范之配定，与改左字者，一状领过。”
或曰：今禅林以临济代开山配祖，若依其昭穆说，则临济亦当穆位。答曰：若置黄檗像，则固可如所论，然除黄檗，但安临济，故可配左边空位耳，不可为此难。唯是安像法，本于《清规·百丈陪于右说，故临济可在左也，实与今禅林安位相反焉。如今之配置，盖依《林间录》而已。
《罗湖野录》云：“隆禅师及住虎丘，道大显着。因追绎白云端和尚立祖堂故事，乃曰：‘为人之后不能躬行遗训，于义安乎？’遂图像奉安，题赞于上：达磨，曰：‘阖国人难挽，西携只履归。只应熊耳月，千古冷光辉。’百丈，曰：‘迅雷吼破澄潭月，当下曾经三日聋。去却膏肓必死疾，丛林从此有家风。’开山明教大师，曰：‘春至百花触处开，幽香旖旎袭人来。临风无限深深意，声色堆中绝点埃。’呜呼！百丈创立禅规以来，丛林卒不至于阤废，实本于此。白云以百丈配享达磨，有识靡不韪其议，可谓知本矣。隆既能遵行奉先之礼，又从而为赞发明其道，有足多也。”